COVID-⁠19 Suisse

Informations sur la situation actuelle, état au 29 juillet 2021

Évolution de l'épidémie,Suisse et Liechtenstein

Variants du virus pertinents

Ces données sont basées sur les déclarations des laboratoires qui procèdent au séquençage du virus ou examinent spécifiquement les mutations. Les résultats sont saisis via notre système de déclaration et par le biais d’un programme national de surveillance du SARS-⁠CoV-⁠2.

Aperçu des variantes du virus

Variants du virus pertinents, Suisse et Liechtenstein, 28.09.2020 au 29.07.2021

Les variants du virus sont déterminés et classés en fonction des mutations dans leur génome (modification du matériel génétique). Pour certains variants du SARS-⁠⁠CoV-⁠⁠2, les mutations entraînent une modification des agents pathogènes comme un risque accru d’infection, une évolution grave de la maladie, le risque d’une nouvelle infection ou un niveau de protection vaccinale réduit. La propagation de ces variants peut influer sur la situation épidémiologique. C’est pourquoi ils sont classés en tant que variants pertinentes et font l’objet d’une surveillance particulière.

L’OMS a classé les différentes variantes en deux catégories : les VOC (Variants Of Concern ; français : variantes préoccupantes) et les VOI (Variants Of Interest ; français: variantes à suivre).
En Suisse et dans la Principauté de Liechtenstein, le classement des variantes peut différer de celui de l’OMS car la pertinence des variantes dépend de leur incidence régionale actuelle.

Le variant B.1.1.7– Alpha (découverte pour la première fois en Grande-⁠⁠Bretagne en septembre 2020) est le variant le plus répandu en Suisse et dans la Principauté de Liechtenstein depuis mi-⁠⁠février 2021. Par conséquent, il n’est plus classé comme VOC depuis mai 2021 dans ces deux pays.

Les laboratoires nous transmettent les résultats de l’analyse axée sur les cas via le système de déclaration. Il s’agit d’une analyse ciblée des différentes mutations ou du séquençage partiel ou complet du génome, tandis que la surveillance systématique de variants de virus en circulation repose sur le séquençage ciblé et complet du génome à partir d’un échantillon représentatif. Les données ainsi collectées permettent d’estimer la proportion de chacun des variants et d’identifier des variants jusqu’ici inconnus.

Système de déclaration: Les résultats de l’analyse axée sur les cas nous sont transmis via le système de déclaration. Il s’agit soit d’une analyse ciblée des différentes mutations, soit du séquençage partiel ou complet du génome. Les données sont essentiellement collectées dans le cadre d‘une analyse ciblée (par exemple, études de flambées, infections post-⁠vaccinales et réinfections). Il ne s’agit donc pas d’échantillons représentatifs.

Surveillance: Les résultats de la surveillance se basent sur le séquençage complet du SARS-⁠CoV-⁠2. Dans le cadre de la surveillance, un laboratoire procède au séquençage d‘échantillons positifs au SARS-⁠CoV-⁠2, sélectionnés de manière aléatoire, ce qui permet d’avoir une vue d’ensemble représentative à l’échelle nationale des variantes de virus actuellement en circulation. Les données nous permettent d’estimer la proportion de chacune des variantes et d‘identifier des variantes jusqu’ici inconnues.

Variantes Système de déclaration Surveillance
B.1.351 – Beta

Ce variant est considéré comme préoccupant (VOC) en raison du risque d’une nouvelle infection et de l’efficacité réduite de la vaccination contre le COVID-⁠⁠19. Il a été découvert pour la première fois en Afrique du Sud en mai 2020.

Système de déclaration

250

Surveillance

257
P.1 – Gamma

Ce variant est considéré comme préoccupant (VOC) en raison du risque d’une nouvelle infection et de l’efficacité réduite de la vaccination contre le COVID-⁠⁠19. Il a été découvert pour la première fois au Brésil et au Japon fin 2020.

Système de déclaration

24

Surveillance

177
B.1.617.2 – Delta

Ce variant est considéré depuis début mai 2021 comme préoccupant (VOC) en raison du risque accru d’infection, du risque accru d’une nouvelle infection et de l’efficacité réduite de la vaccination contre le COVID-⁠⁠⁠19. Il a été découvert pour la première fois en Inde en octobre 2020.

Système de déclaration

514

Surveillance

1100
B.1.617.1 – Kappa

Il s’agit d’un variant à suivre (VOI) en raison du risque d’une nouvelle infection et de l’efficacité réduite de la vaccination contre le COVID-⁠⁠19. Comme il est peu répandu en Suisse et dans la Principauté de Liechtenstein, il n’est pas considéré comme préoccupant. Il a été découvert pour la première fois en Inde en octobre 2020.

Système de déclaration

1

Surveillance

15
B.1.1.7 – Alpha

Ce variant (découvert pour la première fois en Grande-⁠⁠Bretagne en septembre 2020) est considéré, à l’échelle internationale, comme préoccupant (VOC) en raison du risque accru d’infection. En Suisse et dans la Principauté de Liechtenstein, ce variant détermine l’incidence de l’infection depuis mi-⁠⁠février 2021. Par conséquent, il n’est plus considérée comme VOC dans ces deux pays depuis mai 2021.

Système de déclaration

18 167

Surveillance

20 425
P.2 – Zeta

Il s’agit d’un variant à suivre (VOI) en raison du risque d’une nouvelle infection et de l’efficacité réduite de la vaccination contre le COVID-⁠⁠19. Comme il est peu répandu en Suisse et dans la Principauté de Liechtenstein, il n’est pas considéré comme préoccupant. Il a été découvert pour la première fois au Brésil en avril 2020.

Système de déclaration

32

Surveillance

17
B.1.525 – Eta

Il s’agit d’un variant à suivre (VOI) en raison du risque d’une nouvelle infection et de l’efficacité réduite de la vaccination contre le COVID-⁠⁠19. Comme il est peu répandu en Suisse et dans la Principauté de Liechtenstein, il n’est pas considéré comme préoccupant. Il a été découvert pour la première fois au Nigeria et dans d’autres pays en décembre 2020.

Système de déclaration

4

Surveillance

41
B.1.526 – Iota

Il s’agit d’un variant à suivre (VOI) en raison du risque d’une nouvelle infection et de l’efficacité réduite de la vaccination contre le COVID-⁠⁠19. Comme il est peu répandu en Suisse et dans la Principauté de Liechtenstein, il n’est pas considéré comme préoccupant. Il a été découvert pour la première fois aux Etats-⁠Unis en novembre 2020.

Système de déclaration

-

Surveillance

9
B.1.1.7 & E484K

Il s’agit d’une variante à suivre (VOI) en raison du risque accru d’infection et du risque accru d’une nouvelle infection Comme elle est peu répandue en Suisse et dans la Principauté de Liechtenstein, elle n’est pas considérée comme préoccupante.

Système de déclaration

0

Surveillance

-
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covid19.admin.ch
Source: OFSP (Système de déclaration) – État : 29.07.2021, 07 h 47
Source: OFSP (Surveillance) – État : 29.07.2021, 08 h 02

Chronologie

Variants du virus pertinents, Suisse et Liechtenstein, 28.09.2020 au 29.07.2021

La surveillance systématique des variants de virus en circulation repose sur le séquençage ciblé et complet du génome à partir d’un échantillon représentatif. Les données ainsi collectées permettent d’estimer la proportion de chacun des variants et d’identifier des variants jusqu’ici inconnus.

Le graphique montre l’évolution de la proportion estimée des variants de virus pertinents au cours de la période sélectionnée en Suisse et dans la Principauté de Liechtenstein. La ligne représente la moyenne quotidienne mobile sur 7 jours (moyenne des 3 jours précédents jusqu’aux 3 jours suivants). L’histogramme contient le nombre journalier d’échantillons séquencés complètement.

Pour chacun des variants sélectionnés, les valeurs journalières sont délimitées par une valeur supérieure et une valeur inférieure, qui représentent une probabilité de 95 %.
B.1.351 – Beta
P.1 – Gamma
B.1.617.2 – Delta
Proportion estimée de variantes de virus pertinentes (moyenne sur 7 jours)
Séquençage d’échantillons
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covid19.admin.ch
Source: OFSP (Surveillance) – État : 29.07.2021, 08 h 02